GROMACS编译 Windows系统

Mon, 04 May 2026 13:16:49 +0800

GROMACS with fftpack

Windows原生环境下使用MinGW和CMake编译使用fftpack的GROMACS。 GROMACS源代码下载：GROMACS下载地址。工具准备：MinGW，CMake，Python。

从Github上MinGW的release页面下载x86_64-[版本号]-release-win32-seh-ucrt-rt_v12-rev0.7z版MinGW编译器，并解压到任意目录，比如 D:/mingw64 。将 D:/mingw64/bin 目录添加到系统环境变量PATH中。在PowerShell中使用 gcc --version 或 g++ --version 命令查看版本验证MinGW是否安装成功。从CMake和Python官网下载对应Windows系统版本的安装程序，安装时勾选添加到环境变量。安装完成后在PowerShell中使用 cmake --version 和 python --version 查看版本信息验证安装。

下载GROMACS源代码，解压到任意目录，比如 F:/VSCodeFile/GROMACS/ 。使用 tar -zxvf [源代码文件名] 解压GROMACS源代码，并进入该目录。在PowerShell中执行以下命令：

cd F:/VSCodeFile/GROMACS
tar -zxvf gromacs-2024.5.tar.gz
cd gromacs-2024.5

进入解压目录后，使用以下指令构建CMake项目：

cmake -S . -B build -G "MinGW Makefiles" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=F:/GROMACS-fftpack -DGMX_FFT_LIBRARY=fftpack -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release
cmake --build build --target install

cmake参数解释： -S . 指定当前目录作为源代码目录； -B build 指定构建目录为build文件夹，用于存放编译过程中生成的文件； -G "MinGW Makefiles" 指定使用MinGW的Makefile生成器。“MinGW Makefiles"生成器会构建MinGW编译器的makefile文件。使用 cmake -G 查看所有可用的生成器； -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=指定的GROMACS安装路径 ，比如作者的安装路径 F:/GROMACS-fftpack ； -DGMX_FFT_LIBRARY=fftpack 指定使用fftpack库支持FFT (Fast Fourier Transform) 计算。还可以使用fftw3，mkl等其他库； -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release 指定编译类型为发布模式，编译器一般会对Release模式进行优化，提高运行效率； --build build 指定CMake构建目录，进行编译安装； --target install 构建install目标，使用CMakeLists.txt中的install()命令进行安装；更多编译选项可查看GROMACS官方文档。

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